С 23 июня 1941 года Реутов перешел на военные рельсы: началось призывное движение и переведены на защиту Родины промышленные предприятия, которые начали выпускать военную продукцию. Изменился и транспорт, и аграрный сектор:
1. На заводе по производству протезов изготавливались искусственные конечности и ортопедическая обувь.
2. В прядильной фабрике шили белье для солдат, занимались ремонтом стрелкового оружия и производили мокрую пряжу для парашютных строп.
3. Железнодорожная станция «Реутово» работала круглосуточно, отправляя и принимая составы с военной техникой и личным составом.
После указа о мобилизации более 1200 реутовчан ушли на фронт в первые месяцы войны. 29 октября 1941 года стартовало возведение оборонительных линий вокруг Москвы. В этом участвовал отряд из 700 человек, в основном женщин.
В Реутове также сформировали рабочий отряд для уничтожения вражеской техники и партизанский. В восточной части города был размещен штаб 250-го зенитно-артиллерийского полка. * На здании школы №2 города Реутов, на месте которой был расположен штаб, 6 мая 2004 года установлена мемориальная доска*
В Реутове были развернуты два военных эвакогоспиталя №2884 (1942 г.) и №4458(1944 г.). За годы войны через эвакогоспитали г. Реутова прошли тысячи раненых бойцов, многие из которых вновь вернулись на фронт и встали в ряды защитников Отечества.
В 1944-1945 году на базе военного госпиталя №2884 в бывшем здании Райисполкома (сейчас – ул. Ленина, д. 25) была организована протезно-сборочная мастерская, а затем – Протезно-ортопедический завод. Всего за годы Великой Отечественной на фронт ушли более 5000 реутовчан. В боях за Родину погибло 960 жителей Реутова.
